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曾志林虽贵为开国伯、殿前司副都指挥使、右金吾卫上将军、领兖州防御使、南征军西路军都指挥使、右路军都指挥使，且担任此番金陵攻城战的前敌总指挥，可以他的身份绝无坦然受李煜这一国之主跪拜礼的道理。所以，面对拜伏于地的李煜及江南一众臣武将，曾志林连忙下马侧身还礼，并请对方暂且起身，待自家主帅五哥王崤峻到后再行正式投降仪式，并亲自陪在李煜身边一起等候王崤峻的到来。
实际上，金陵城南、东、北三个方向的城墙被突破、周吴联军十万大军杀进城的同时，王崤峻便已经率大周南征军一众武在亲卫营和“游骑兵营”的护卫下进了城。只是，一来城内的巷战一时尚未结束，二来城内的秩序亦需要尽力维持，所以入城之初，王崤峻及徐绍安等人的主要精力都放在打击江南军残余抵抗力量以及恢复城内治安秩序方面，并未太过关注宫城这边的情况。
说起来，虽然破城之时城内一片混乱，但制造混乱的主体却并不是人数最多的大周南征军，而是打算趁火打劫、浑水摸鱼的江南军溃兵，以及与江南宿怨很深，意欲进行报复的吴越军兵将。对于江南军溃兵和吴越军兵将的行为，希望能以最小的损失攻克金陵城的王崤峻、徐绍安等南征军统率自然不能接受。毕竟，早在攻城之前，王崤峻便已下令各部务必整肃军纪，不得欺扰百姓。吴越军作为归南征军主帅节制的仆从国力量，自然也要遵守这一帅令。如今他们在城内烧杀抢掠、肆意报复，视军令如无物，王崤峻、徐绍安等人又如何能听之任之。因此，甫一进城，王崤峻便下令由南征军军法司官员、亲卫营、参战的“飞龙军”各师宪兵连，以及“狼牙营”混编组成若干个军纪整肃行动队，分散到金陵城的各个角落，对趁火打劫的江南军溃兵、烧杀抢掠的吴越军兵将，以及个别敢于违反军纪的南征军官兵进行整肃和处罚。
不过整肃归整肃，对不同对象的整肃方式却是完全不同。按照王崤峻的命令，对于趁火打劫的江南军溃兵，无论其造成的破坏与损失有多大，一律就地格杀勿论；对于烧杀抢掠的吴越军兵将，凡不涉及人命的，重责四十军棍到八十军棍，并没收其抢掠的所有财物。凡涉及人命或**掳掠女者，一律就地正法；对于敢于违反军纪的南征军官兵，则一律当场拘捕，交由南征军军法司依军规给予严惩。
随着各路军纪整肃行动队深入到金陵城的各个角落，原本已经稀疏的枪声、爆炸声也随之突然再次繁密起来。不过，这种枪声大做就像回光反照一般，来得快去的也快，不过小半个时辰的光景，城内的枪声和爆炸声便愈来愈疏落，直至完全消失，而因为攻城战以及溃兵、怒兵、恶兵的扰动而混乱不堪的金陵城也在下午酉时初渐渐平静了下来。
金陵城内渐趋平静，市面秩序基本恢复，王崤峻因周吴联军特别是吴越不遵帅令而略显烦躁的心情却并没有因此而平复下来，反而在得到各路军纪整肃行动队的报告后变得愈加恼怒。
根据几支军纪整肃行动队的报告，破城之初，一股吴越军闯入江南勤政殿学士钟篟府，见对方身着朝服坐于大堂之上，并对自己闯入其府邸的行为大声喝斥，顿时火起，不由分说便将钟篟及其家人仆役全部斩杀，连五岁的娃娃都不放过。而另一股吴越军则将藏有上百名躲避战火的富商大贾及其近千名家眷和随从的瓦官寺“升元阁”团团围住，要楼内商贾即时交纳巨额银钱才肯放其离去。然则，这些富商大贾皆是为了躲避战火临时起意逃到这座在他们看来能够趋吉避凶的佛寺之避难的，怎么可能随身携带大量金银财货。可面对“升元阁”外那群凶神恶煞一般的吴越军，这些商贾为了保命，只好将身上所有值钱的东西收集在一起交给围阁的吴越军，只求对方能够略微宽限一点时间，好让随从们回家取银钱来赎身。